科学家为寻找新的SARS-CoV-2新变种而开发出低成本技术

2021年06月23日 17:27 次阅读 稿源:cnBeta.COM 条评论

瑞典卡罗林斯卡学院的研究人员开发了一种技术,用于对新的SARS-CoV-2变种的全球传播进行具有成本效益的监测。(SARS-CoV-2是导致COVID-19的病毒)该技术进展在科学杂志《自然-通讯》上发表。

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自从COVID-19大流行发生以来,成千上万的病毒基因组已经被测序,以重建冠状病毒的进化和全球传播。这对于识别特别是有关传染性更强、致病性更强或对现有疫苗有抵抗力的变种非常重要。

对于SARS-CoV-2基因组的全球监测,以一种具有成本效益的方式对许多样本进行测序和分析是至关重要的。因此,瑞典卡罗林斯卡学院Bienko-Crosetto实验室和科学生命实验室(SciLifeLab)的研究人员开发了一种名为COVseq的新方法,可用于大规模的病毒基因组监测,而且成本低。

他们的方法是,首先使用所谓的多重PCR(聚合酶链反应)创建许多病毒基因组副本,然后,使用Bienko-Crosetto实验室以前开发的一种方法,将样本标记并汇集到同一个测序库中,现在被改编为用于SARS-CoV-2分析。

卡罗林斯卡医学院医学生物化学和生物物理学系的博士后研究员张宁说:"通过以非常小的体积进行反应并将数百个样本汇集到同一个测序库中,我们每周可以对潜在的数千个病毒基因组进行测序,而每个样本的成本不到15美元。"

对29个SARS-CoV-2阳性样本的比较分析显示,COVseq在识别基因组的小变化方面具有与标准方法类似的能力。对另外245个样本的分析显示,COVseq也有很高的能力来检测可能引起关注的新出现的冠状病毒变种。与现有方法相比,COVseq的关键优势在于成本效益。

卡罗林斯卡学院医学生物化学和生物物理学系的高级研究员、该论文的最后一位作者Nicola Crosetto说:"我们的廉价方法可以立即用于SARS-CoV-2的基因组监测,也可以很容易地适应其他RNA病毒,如流感和登革热病毒。"

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