#GenigmaChallenge:邀请游戏玩家来解开谜题并帮助推进癌症研究

CRG和CNAG-CRG推出#GenigmaChallenge,这是一项公民科学倡议,也是一款电子游戏,招募玩家解开谜题,同时产生真实世界的科学数据,以检测基因组序列的改变,最终推动乳腺癌研究。

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该游戏今天在iOS和Android系统上发布,有英语、西班牙语、加泰罗尼亚语和意大利语版本,是由基因组监管中心(CRG)、国家基因分析中心(CNAG-CRG)的研究人员和游戏专业人士组成的团队开发的一个为期两年半的研究成果。

该游戏的创建是为了促进世界范围内依赖癌细胞系的研究工作,癌细胞系是科学家用于研究癌症和测试治疗疾病的新药物的重要资源。癌症细胞系的局限性之一是缺乏高分辨率的基因组参考图,这对于帮助研究人员解释他们的科学成果是必要的,例如确定治疗兴趣基因的位置或潜在突变位点。

"细胞系负责发现疫苗、癌症的化学疗法或不孕症的试管婴儿。这使得它们成为现代生物学的支柱,"ICREA研究教授Marc A. Marti-Renom解释说,他在CRG和CNAG-CRG有双重关系,其研究是GENIGMA的基础。"然而,基因组参考图的缺乏限制了当前的科学进步。这就像要求人们用过去的地图为现代城市导航一样。在其他人的帮助下,我们可以更新这些地图,这将使我们在乳腺癌研究方面取得快速进展。"

Marti-Renom教授的研究小组已经开发了通过在三维空间中可视化基因组来创建基因组参考地图的方法。然而,这需要大量的时间和资源来训练人工智能,以及庞大的计算能力。

研究人员推出GENIGMA是因为他们相信,与单独使用人工智能相比,玩家产生的数据可能是一种更有效的更新参考图的方法。玩家的"群居智能"也能以人工智能可能无法做到的方式提供创造性解决方案。

要玩好GENIGMA,玩家必须解决一个涉及一串不同颜色和形状的方块的难题。每一串代表癌细胞系中的一个基因序列,而玩家如何组织这些方块就是对基因位置的潜在解决方案。

玩家必须重新组织积木,使其达到可能的最高分数。玩家的数量越多,分数越高,研究人员就越有可能在参考地图中找到这个特定位置的正确序列。世界上任何地方拥有智能手机的人都可以免费下载GENIGMA并为研究做出直接贡献,将他们的逻辑和灵巧借给科学服务。GENIGMA将作为一个集体而不是个人来分析玩家提供的解决方案,并将利用确定性算法无法找到的创造性解决方案。

研究人员将尝试解决的第一个基因组参考图是T-47D乳腺癌细胞系,这是癌症研究中最常用的资源之一。GENIGMA的研究团队估计,3万名玩家平均每人解决50个游戏,将产生足够的数据来揭示这个乳腺癌细胞系的20.000个基因的参考图。

该游戏于2022年1月27日启动,并开展了为期三个月的活动--#GenigmaChallenge。在总共三个月的时间里,每周一,GENIGMA团队将从T-47D细胞系中引入新的基因组片段,由玩家进行排列。第一个需要排列的基因组片段来自17号染色体,其中包含大量的乳腺癌相关基因。这包括BRCA1,其突变与大约40%的遗传性乳腺癌有关。

GENIGMA的开发历时两年半,涉及13个工作室的500多人。该游戏由来自不同背景的人构思和测试,包括研究人员、学生、教师、艺术家、医学专家、生物伦理学家、记者、病人组织的代表、艺术家和游戏开发者。

据JOCS al SEGON的创意和GENIGMA游戏设计团队的协调员Oriol Ripoll说:"对于大多数人来说,科学往往让人感觉难以企及,这就是为什么能够拿起手机玩GENIGMA是如此令人兴奋。你不仅可以结合电子游戏的普遍吸引力和受欢迎程度,为推进医学研究做出贡献,你还可以学到更多科学知识"。

GENIGMA由ORION资助,这是一个为期4年的项目,获得了欧盟地平线2020研究和创新计划的资助,资助协议号为741527。该项目解决了地平线2020年科学与社会和为社会工作计划下的 "SwafS-04-2016 "呼吁。GENIGMA也是与'Fondazione ANT Italia Onlus'和Arima Genomics合作的结果。

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